MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132

Total Repeats: 66719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016941	ATT	2	6	126	131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016941	AAT	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016941	TAT	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016941	AGA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016941	TG	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016941	GTC	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016941	ATTT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016941	TTA	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016941	ATT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016941	GT	3	6	446	451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016941	AAGA	2	8	499	506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016941	TAT	2	6	643	648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794528
13	NC_016941	CAA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794528
14	NC_016941	TGT	2	6	719	724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379794528
15	NC_016941	TAC	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794528
16	NC_016941	TAA	2	6	779	784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794528
17	NC_016941	TCT	2	6	816	821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379794528
18	NC_016941	AAC	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794528
19	NC_016941	AG	3	6	855	860	50 %	0 %	50 %	0 %	379794528
20	NC_016941	GCA	2	6	924	929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379794528
21	NC_016941	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794528
22	NC_016941	TA	3	6	977	982	50 %	50 %	0 %	0 %	379794528
23	NC_016941	ATGC	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	379794528
24	NC_016941	TCA	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794528
25	NC_016941	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794528
26	NC_016941	TTA	2	6	1164	1169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794528
27	NC_016941	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794528
28	NC_016941	AAG	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
29	NC_016941	ACC	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379794528
30	NC_016941	AGA	2	6	1304	1309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
31	NC_016941	TTG	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379794528
32	NC_016941	CCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379794528
33	NC_016941	AGA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
34	NC_016941	GAA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
35	NC_016941	CCA	2	6	1422	1427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379794528
36	NC_016941	TA	3	6	1440	1445	50 %	50 %	0 %	0 %	379794528
37	NC_016941	CAAAT	2	10	1447	1456	60 %	20 %	0 %	20 %	379794528
38	NC_016941	ATT	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794528
39	NC_016941	CTG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379794528
40	NC_016941	GTA	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794528
41	NC_016941	A	6	6	1662	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	379794528
42	NC_016941	AG	3	6	1716	1721	50 %	0 %	50 %	0 %	379794528
43	NC_016941	GAA	2	6	1752	1757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
44	NC_016941	GGCG	2	8	1761	1768	0 %	0 %	75 %	25 %	379794528
45	NC_016941	CA	3	6	1773	1778	50 %	0 %	0 %	50 %	379794528
46	NC_016941	AGA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
47	NC_016941	AAG	2	6	1840	1845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794528
48	NC_016941	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016941	TA	3	6	1910	1915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016941	AAT	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016941	TAA	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016941	ATG	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016941	AC	3	6	2010	2015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016941	CTA	3	9	2091	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016941	TA	3	6	2119	2124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016941	ATG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794529
57	NC_016941	ATT	2	6	2184	2189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
58	NC_016941	TTA	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
59	NC_016941	AAC	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794529
60	NC_016941	TTG	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379794529
61	NC_016941	A	7	7	2419	2425	100 %	0 %	0 %	0 %	379794529
62	NC_016941	ATTA	2	8	2473	2480	50 %	50 %	0 %	0 %	379794529
63	NC_016941	AATTT	2	10	2496	2505	40 %	60 %	0 %	0 %	379794529
64	NC_016941	TTA	2	6	2534	2539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
65	NC_016941	CAATT	2	10	2562	2571	40 %	40 %	0 %	20 %	379794529
66	NC_016941	GACT	2	8	2695	2702	25 %	25 %	25 %	25 %	379794529
67	NC_016941	AGA	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794529
68	NC_016941	TCA	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794529
69	NC_016941	TAAA	2	8	2790	2797	75 %	25 %	0 %	0 %	379794529
70	NC_016941	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794529
71	NC_016941	TCT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379794529
72	NC_016941	ATT	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
73	NC_016941	ACA	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794529
74	NC_016941	AAATT	2	10	2940	2949	60 %	40 %	0 %	0 %	379794529
75	NC_016941	TTA	2	6	2996	3001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
76	NC_016941	TTA	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794529
77	NC_016941	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794529
78	NC_016941	GTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379794529
79	NC_016941	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379794529
80	NC_016941	AGA	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794529
81	NC_016941	ATG	2	6	3111	3116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794529
82	NC_016941	TTTC	2	8	3138	3145	0 %	75 %	0 %	25 %	379794529
83	NC_016941	AT	3	6	3154	3159	50 %	50 %	0 %	0 %	379794529
84	NC_016941	GAC	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379794529
85	NC_016941	AATT	2	8	3264	3271	50 %	50 %	0 %	0 %	379794529
86	NC_016941	TTAA	2	8	3321	3328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016941	T	6	6	3344	3349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016941	AAT	2	6	3356	3361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016941	TAAAA	2	10	3376	3385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016941	TAAA	2	8	3405	3412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016941	TGAA	2	8	3418	3425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016941	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016941	AAATTA	2	12	3547	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016941	AAT	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016941	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016941	CT	3	6	3611	3616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016941	A	7	7	3636	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016941	AT	3	6	3649	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016941	ATT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016941	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794530
101	NC_016941	GTA	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794530
102	NC_016941	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794530
103	NC_016941	TGG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379794530
104	NC_016941	ATTA	2	8	3799	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	379794530
105	NC_016941	TTCT	2	8	3889	3896	0 %	75 %	0 %	25 %	379794530
106	NC_016941	TCAT	2	8	3900	3907	25 %	50 %	0 %	25 %	379794530
107	NC_016941	ATG	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794531
108	NC_016941	AATC	2	8	4040	4047	50 %	25 %	0 %	25 %	379794531
109	NC_016941	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	379794531
110	NC_016941	AGA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794531
111	NC_016941	CTC	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379794531
112	NC_016941	GAC	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379794531
113	NC_016941	CTG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379794531
114	NC_016941	AAT	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794531
115	NC_016941	CAG	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379794531
116	NC_016941	ATT	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794531
117	NC_016941	GAT	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794531
118	NC_016941	TTA	3	9	4855	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794531
119	NC_016941	GAT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794531
120	NC_016941	TTA	2	6	4906	4911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794531
121	NC_016941	ACA	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794532
122	NC_016941	GTAT	2	8	5138	5145	25 %	50 %	25 %	0 %	379794532
123	NC_016941	CGA	2	6	5208	5213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379794532
124	NC_016941	A	6	6	5315	5320	100 %	0 %	0 %	0 %	379794532
125	NC_016941	TGG	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379794532
126	NC_016941	CGG	2	6	5376	5381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379794532
127	NC_016941	TGG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379794532
128	NC_016941	TCA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794532
129	NC_016941	GTA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794532
130	NC_016941	ATC	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794532
131	NC_016941	A	6	6	5500	5505	100 %	0 %	0 %	0 %	379794532
132	NC_016941	ACA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794532
133	NC_016941	AT	3	6	5605	5610	50 %	50 %	0 %	0 %	379794532
134	NC_016941	AG	3	6	5638	5643	50 %	0 %	50 %	0 %	379794532
135	NC_016941	TAAA	2	8	5654	5661	75 %	25 %	0 %	0 %	379794532
136	NC_016941	TGA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794532
137	NC_016941	ATT	2	6	5754	5759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794532
138	NC_016941	AGAA	2	8	5768	5775	75 %	0 %	25 %	0 %	379794532
139	NC_016941	ATG	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794532
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141	NC_016941	GAT	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794532
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161	NC_016941	AATG	2	8	6795	6802	50 %	25 %	25 %	0 %	379794532
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239	NC_016941	CTATA	2	10	9742	9751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_016941	TAT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_016941	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016941	CAA	2	6	10763	10768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_016941	TAT	3	9	10769	10777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016941	ATA	2	6	10805	10810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016941	AATA	2	8	10841	10848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016941	AAG	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016941	ACA	3	9	10963	10971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379794535
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269	NC_016941	ACAAT	2	10	11116	11125	60 %	20 %	0 %	20 %	379794535
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396	NC_016941	AT	3	6	16418	16423	50 %	50 %	0 %	0 %	379794539
397	NC_016941	TGG	2	6	16440	16445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379794539
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